MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis TI0902 chromosome

Total Repeats: 35111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016937	TTA	2	6	26	31	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725074
2	NC_016937	T	6	6	37	42	0 %	100 %	0 %	0 %	379725074
3	NC_016937	A	8	8	69	76	100 %	0 %	0 %	0 %	379725074
4	NC_016937	A	9	9	78	86	100 %	0 %	0 %	0 %	379725074
5	NC_016937	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	379725074
6	NC_016937	CAA	2	6	221	226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379725074
7	NC_016937	ATT	2	6	253	258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725074
8	NC_016937	TAA	2	6	267	272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725074
9	NC_016937	A	6	6	271	276	100 %	0 %	0 %	0 %	379725074
10	NC_016937	A	6	6	287	292	100 %	0 %	0 %	0 %	379725074
11	NC_016937	T	7	7	327	333	0 %	100 %	0 %	0 %	379725074
12	NC_016937	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379725074
13	NC_016937	AGA	2	6	366	371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379725074
14	NC_016937	AGT	2	6	378	383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725074
15	NC_016937	AAG	2	6	403	408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379725074
16	NC_016937	TCA	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379725074
17	NC_016937	AGA	2	6	480	485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379725074
18	NC_016937	TGT	2	6	540	545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379725074
19	NC_016937	AGC	3	9	570	578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379725074
20	NC_016937	TGG	2	6	630	635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379725074
21	NC_016937	GCAA	2	8	663	670	50 %	0 %	25 %	25 %	379725074
22	NC_016937	ATT	2	6	709	714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725074
23	NC_016937	TTA	2	6	734	739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725074
24	NC_016937	CAAGAT	2	12	766	777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725074
25	NC_016937	TGAT	2	8	815	822	25 %	50 %	25 %	0 %	379725074
26	NC_016937	GAA	2	6	952	957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379725074
27	NC_016937	A	6	6	1039	1044	100 %	0 %	0 %	0 %	379725074
28	NC_016937	CAG	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379725074
29	NC_016937	GTAC	2	8	1102	1109	25 %	25 %	25 %	25 %	379725074
30	NC_016937	TAC	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379725074
31	NC_016937	CTA	2	6	1178	1183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379725074
32	NC_016937	GCTT	2	8	1198	1205	0 %	50 %	25 %	25 %	379725074
33	NC_016937	AAGAA	2	10	1226	1235	80 %	0 %	20 %	0 %	379725074
34	NC_016937	ATA	2	6	1247	1252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725074
35	NC_016937	GTT	2	6	1261	1266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379725074
36	NC_016937	AAG	2	6	1311	1316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379725074
37	NC_016937	TGG	2	6	1404	1409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379725074
38	NC_016937	ATGC	2	8	1429	1436	25 %	25 %	25 %	25 %	379725074
39	NC_016937	GAT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725074
40	NC_016937	TAAA	2	8	1519	1526	75 %	25 %	0 %	0 %	379725074
41	NC_016937	A	6	6	1553	1558	100 %	0 %	0 %	0 %	379725075
42	NC_016937	TAT	2	6	1643	1648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725075
43	NC_016937	ATA	3	9	1670	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725075
44	NC_016937	AGTT	2	8	1731	1738	25 %	50 %	25 %	0 %	379725075
45	NC_016937	TGAT	2	8	1814	1821	25 %	50 %	25 %	0 %	379725075
46	NC_016937	TAA	2	6	1857	1862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725075
47	NC_016937	AGCA	2	8	1928	1935	50 %	0 %	25 %	25 %	379725075
48	NC_016937	CAA	2	6	1951	1956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379725075
49	NC_016937	TCA	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379725075
50	NC_016937	TAT	2	6	1968	1973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725075
51	NC_016937	ATG	2	6	2000	2005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725075
52	NC_016937	CTA	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379725075
53	NC_016937	A	7	7	2151	2157	100 %	0 %	0 %	0 %	379725075
54	NC_016937	AGA	2	6	2193	2198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379725075
55	NC_016937	ATA	2	6	2315	2320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725075
56	NC_016937	ATT	2	6	2361	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725075
57	NC_016937	TAA	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725075
58	NC_016937	GAA	2	6	2560	2565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379725075
59	NC_016937	TCTA	2	8	2572	2579	25 %	50 %	0 %	25 %	379725075
60	NC_016937	ATA	2	6	2624	2629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725075
61	NC_016937	GTTT	2	8	2630	2637	0 %	75 %	25 %	0 %	379725075
62	NC_016937	ATT	2	6	2638	2643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725075
63	NC_016937	AT	3	6	4770	4775	50 %	50 %	0 %	0 %	379725076
64	NC_016937	TTTGC	2	10	4784	4793	0 %	60 %	20 %	20 %	379725076
65	NC_016937	AATA	2	8	4916	4923	75 %	25 %	0 %	0 %	379725076
66	NC_016937	CGTAC	2	10	4928	4937	20 %	20 %	20 %	40 %	379725076
67	NC_016937	AGT	3	9	4997	5005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725076
68	NC_016937	AGC	2	6	5035	5040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379725076
69	NC_016937	TGC	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379725076
70	NC_016937	TTA	2	6	5093	5098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725076
71	NC_016937	AGC	2	6	5106	5111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379725076
72	NC_016937	AGA	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379725076
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74	NC_016937	GAT	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725076
75	NC_016937	TCT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379725076
76	NC_016937	TACT	2	8	5208	5215	25 %	50 %	0 %	25 %	379725076
77	NC_016937	T	6	6	5225	5230	0 %	100 %	0 %	0 %	379725076
78	NC_016937	TGG	2	6	5260	5265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379725076
79	NC_016937	TTCAA	2	10	5299	5308	40 %	40 %	0 %	20 %	379725076
80	NC_016937	TTG	2	6	5346	5351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379725076
81	NC_016937	CTA	2	6	5360	5365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379725076
82	NC_016937	TTGCG	2	10	5387	5396	0 %	40 %	40 %	20 %	379725076
83	NC_016937	CTG	3	9	5403	5411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379725076
84	NC_016937	TGG	2	6	5545	5550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379725076
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86	NC_016937	CTAT	2	8	5627	5634	25 %	50 %	0 %	25 %	379725076
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88	NC_016937	CTG	2	6	5652	5657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379725076
89	NC_016937	TTG	2	6	5721	5726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379725076
90	NC_016937	TGTT	2	8	5874	5881	0 %	75 %	25 %	0 %	379725076
91	NC_016937	TA	3	6	5883	5888	50 %	50 %	0 %	0 %	379725076
92	NC_016937	GTT	2	6	5905	5910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379725076
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99	NC_016937	ATTA	2	8	6511	6518	50 %	50 %	0 %	0 %	379725077
100	NC_016937	ATA	2	6	6558	6563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725077
101	NC_016937	GATA	2	8	6719	6726	50 %	25 %	25 %	0 %	379725077
102	NC_016937	TGA	2	6	6751	6756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725077
103	NC_016937	AGAT	2	8	6792	6799	50 %	25 %	25 %	0 %	379725077
104	NC_016937	TGA	2	6	6817	6822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725077
105	NC_016937	GA	3	6	6845	6850	50 %	0 %	50 %	0 %	379725077
106	NC_016937	AGA	2	6	6991	6996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379725077
107	NC_016937	GAT	2	6	7102	7107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725077
108	NC_016937	TTG	2	6	7125	7130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379725077
109	NC_016937	AT	3	6	7156	7161	50 %	50 %	0 %	0 %	379725077
110	NC_016937	A	6	6	7213	7218	100 %	0 %	0 %	0 %	379725077
111	NC_016937	GAA	2	6	7226	7231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379725077
112	NC_016937	TGAT	2	8	7245	7252	25 %	50 %	25 %	0 %	379725077
113	NC_016937	TAT	2	6	7278	7283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725077
114	NC_016937	TAA	2	6	7366	7371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725077
115	NC_016937	GTT	2	6	7391	7396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379725077
116	NC_016937	GAT	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725077
117	NC_016937	ATGCA	2	10	7434	7443	40 %	20 %	20 %	20 %	379725077
118	NC_016937	AGTT	2	8	7465	7472	25 %	50 %	25 %	0 %	379725077
119	NC_016937	AGA	2	6	7501	7506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379725077
120	NC_016937	TTA	2	6	7533	7538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725077
121	NC_016937	GGT	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379725077
122	NC_016937	TGA	3	9	7621	7629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725077
123	NC_016937	TGG	2	6	7687	7692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379725077
124	NC_016937	TTA	2	6	7716	7721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725077
125	NC_016937	TGC	2	6	7722	7727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379725077
126	NC_016937	AGC	2	6	7824	7829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379725077
127	NC_016937	AAGA	2	8	7853	7860	75 %	0 %	25 %	0 %	379725077
128	NC_016937	TG	3	6	11455	11460	0 %	50 %	50 %	0 %	379725078
129	NC_016937	T	7	7	11526	11532	0 %	100 %	0 %	0 %	379725078
130	NC_016937	GCA	2	6	11589	11594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379725078
131	NC_016937	ATA	2	6	11601	11606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725078
132	NC_016937	TTAT	2	8	11610	11617	25 %	75 %	0 %	0 %	379725078
133	NC_016937	TTTCT	2	10	11665	11674	0 %	80 %	0 %	20 %	379725078
134	NC_016937	TCA	2	6	11703	11708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379725078
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267	NC_016937	GAT	2	6	18146	18151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725084
268	NC_016937	GTT	2	6	18170	18175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379725084
269	NC_016937	AT	3	6	18197	18202	50 %	50 %	0 %	0 %	379725085
270	NC_016937	TAGAT	2	10	18218	18227	40 %	40 %	20 %	0 %	379725085
271	NC_016937	GTG	2	6	18229	18234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379725085
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275	NC_016937	TAT	2	6	18359	18364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725085
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